Två spelbara karaktärer - spela antingen som en manlig karaktär som heter Vent, eller som en kvinna som heter Aile
Detta är första gången någonsin i Mega Man-serien där en kvinna är den spelbara huvudkaraktären
Biometall är nyckeln - för att få bästa möjliga transformation, attackera chefer strategiskt utan att skada dess biometaller, annars kan dess effekter nedgraderas och måste repareras för att återvinna sin fulla potential
Realtidsinformationssystem - kopplar in båda skärmarna i DS-systemet